Žuvinto biosferos rezervato direkcija – biudžetinė įstaiga, jos steigėjas yra Valstybinė saugomų teritorijų tarnyba prie Lietuvos Respublikos Aplinkos ministerijos. Direkcijos tikslas – užtikrinti tarptautinės biosferos pokyčių stebėsenos (monitoringo) įgyvendinimą, gamtosaugos eksperimentų vykdymą bei gamtinių kompleksų apsaugą biosferos rezervate. Direkcijoje dirba 13 darbuotojų, iš jų 8 specialistai.

Pagrindinės direkcijos funkcijos:

• organizuoti gamtinės ekosistemos stabilumo ir biotos komponentų, iš jų Žuvinto pelkinio komplekso, Žaltyčio ežero, vandens paukščių perėjimo ir apsistojimo migracijų metu vietų juose, etaloninių drėgnų plačialapių miškų bendrijų Buktos miško masyve, retųjų augalų ir pievų bendrijų, pelkių ir pievų paukščių, išlikusios Amalvo pelkės ir ežero išsaugojimo darbus;
• organizuoti ir koordinuoti biosferos rezervato gamtinius tyrimus ir stebėjimus, kaupti informaciją apie gamtinės aplinkos komponentų būklę ir pokyčius;
• sudaryti sąlygas taikomiesiems moksliniams tyrimams vykdyti gamtos apsaugos srityje;
• analizuoti žmogaus veiklos poveikį natūralioms ekosistemoms;
• organizuoti sunaikintų ir pažeistų gamtinių kompleksų ir objektų (vertybių) atkūrimą;
• organizuoti biosferos rezervato gamtinių ekosistemų apsaugos programų, gamtotvarkos planų rengimą ir jų įgyvendinimą;
• užtikrinti Žuvinto biosferos rezervato tvarkymo plano (planavimo schemos) laikymąsi;
• vykdyti ekologinį švietimą ir mokymą, propaguoti gamtos apsaugos idėjas;
• vykdyti biosferos rezervato priežiūrą, pagal kompetenciją vykdyti fizinių ir juridinių asmenų ūkinės veiklos kontrolę;